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台湾卫生主管部门3日将H7N9禽流感列入第5类法定传染病，防疫等级从第2级提升到第3级，并成立H7N9流感流行疫情指挥中心。台媒报道，台湾有关部门官员指出，台湾曾于2009年至2011年期间两度在候鸟遗体中检出H7N9病毒，但所幸都没有在附近禽场发现有H7N9的活动迹象。

台湾当局卫生所防疫人员全副武装，在全台养禽户最多的地方，对所有家禽进行消毒，就连水沟等小角落都不放过。台北市已加强监测鸟园、公园、家禽批发市场等94处场所。台“防检局副局长”黄国青指出，H7N9是“低病原性”，只需要监测半径三公里内的养鸡场，不用扑杀。

据介绍，台湾“疾管局”储备有口罩等防疫物资，以及建置传染病防治医疗网，指定应变医院，若疫情暴发则专责收治传染病病人。岛内共有22家感染症医院待命。